Настоятель подворья Феодоровского Городецкого монастыря архимандрит Алексий (Яковлев)
С момента освящения и до революционных событий Феодоровский собор был подворьем Феодоровского Городецкого монастыря Нижегородской епархии. Первым настоятелем собора стал архимандрит Алексий (Яковлев, 1858–?), который руководил монастырем в 1902–1910 годах. Благодаря его неутомимой энергии и удалось соорудить на подворье грандиозный храмовый комплекс.
Будучи монастырским храмом, Феодоровский собор, тем не менее, уже тогда выполнял приходские функции: здесь крестили, венчали, отпевали усопших. Как свидетельствуют документальные источники, большинство церковных треб заказывали крестьяне из губерний, что, вероятнее всего, было связано с близостью Николаевского (ныне Московского) вокзала. В архивах частично сохранились списки служащих храма тех лет, ведомости прихода и расхода денежных средств, расписания совершения служб, переписка о назначениях и перемещениях монашествующих, метрические книги.